光磊's profile庄生梦蝶PhotosBlogLists Tools Help
April 16

行程

每年总会有一段时间,行程特别紧密,最近又开始奔波不定的生活。

先是忍耐住老板的拖沓,终于把manuscript准备到差强人意,月底投出。比预计晚了两个月,不用说,毕业自然要晚两个月。上周五开 committee meeting,大家都挺满意,过几个月得到老板首肯,应该就可以正式启动毕业程序了。现在小小心烦的是毕业之后去处,老板满心期待,留我做博后。我虽然 不急着走,但想出去探探路,怎么和老板说呢?其实说白了,就是找到好的走人,找不到好的暂且留下。老板如果知道我这么对她,一定会崩溃掉,呵呵。

这两天去华盛顿领奖,昨天一早四点出发,开车10个小时,晚上参加完活动,回酒店休息一晚,今早八点开车赶回来。之所以这么急,是因为明天要飞去丹佛开癌 症年会。现在倒在床上,倦意开始浓郁起来,好在明天下午飞机,早上可以多休息会。但是会议还没准备好,program没有看完,明早要计划好五天会议想听 的报告和想看的poster。回来之后要向全实验室转达会议精神,这次只有我自己去,要听的内容很多。

接着还有重头戏,五月份要夫妻双双把家还了,回国一个月。一个最重要的任务就是办婚礼,两边都要请客摆酒,算算时间真有限。老婆陆陆续续买了一些礼物,开 会回来之后还要最后采购一批。在北京和日照的同学、朋友们,给我留一个或发一份最新联系方式,我这里的已经有三年历史,十之八九已经过期了。有心的早点行 动了,以便我们准备礼品、安排聚餐,找不到人、见不着面的,一概不理了。

整天东奔西跑,耽误了不少时间,没办法坐下来踏踏实实的工作。希望六月份从国内回来,能静下心来站好博士最后一班岗。很多东西都想在毕业之前掌握好,很需要一段集中的时间学习。
March 27

人性化服务

Vanderbilt医学中心最近成立了一个Center for Science Communication,请来Vivian Siegel作director。Vivian是什么人呢?很多年前她也是做基础研究的,发了一些很好的论文。后来她到Cell作senior editor,并做到CellMolecular Cell的chief editor,她也是Developmental CellCancer Cell的创刊人。2003年,Vivian加入Public Library of Science,帮助创办了如今声名鹊起的PLOS系列期刊。

所以,Vivian简直就是论文出版界的大姐大。对于什么样的论文更可能被editor喜欢,如何在论文撰写上下功夫,怎样准备cover letter,等一系列在论文投稿过程中可能遇到的问题,她都有着非常丰富的经验。前不久她写了一篇很有意思的文章,The promise of peer review,感兴趣的同学可以去看。

这个新成立的Center for Science Communication有好多任务,但最重要的一项是Manuscript Studio,这是所有Vanderbilt的实验室可以免费使用的一项服务,主要目的是帮助那些有可能投入好杂志的论文。manuscript写成之后,提交给studio,他们进行初筛,选出有希望的文章,组织校内的专家们坐到一起会诊,讨论在投稿之前需要补充什么实验,文章怎么修改。之后在投稿的整个过程中,Vivian也会亲力亲为,辅助从cover letter到rebuttal letter的整个过程,凭借自己多年作editor的经验,和投稿杂志的editor交流,尽最大努力使文章可能被接收。

昨天,在等待了一个月之后,我即将投出的manuscript成为studio开张的第一个案例。具体过程暂不详表,说说我的感受。我觉得这项服务非常人性化,也非常有效果。通常我们在作项目时,关注的是实验结果与推论,即使写文章时也是如此,但在投稿时的着眼点有稍稍不同,除项目本身应该没有纰漏之外,推销更是一门学问。这一步常被忽略掉了,而这个studio的优势之一就是找一些富于经验的老板,坐下来就manuscript本身仔细讨论,除实验之外,讨论的着重点更在如何优化文章,一可以令editor和reviewer眼前一亮,二可以遮掩文章的弱处,甚至巧妙化弱点为优点。

当然在此过程中也学到了很多不同见解,譬如高大全的文章并不是好文章,一篇manuscript要有侧重点与方向感,一些看起来漂亮的数据,并不一定适合整篇文章的布局,应该舍得丢弃掉;再如manuscript和grant不同,grant讲究依据所知,推断将来,基于现有的发现,提出的实验设计和结果预测,在逻辑上应该是缜密的,而manuscript常常忌讳这一点,如果一篇新论文仅仅是前人研究逻辑上的下一步,毫无惊奇,相信没有人会喜欢。

总之我很享受这一项人性化服务,希望以后再有机会去更多得体验它。

February 20

等咱有了钱

当美国总统实在是太爽了。周二一大早,白白净净的黑人小伙奥巴马西装革履,驾上空军一号,直奔克罗拉多,众目睽睽之下大笔一挥,7870亿美元就这样花出去了。这件事情不是每个同学都能干的。

对于科学家们来说,奥巴马简直就是东方来的再生父母,西方来的圣诞老人。因为这7870亿美元的刺激经济方案中,有210多亿注进了科学界。业内人人欢呼,奔走相告,并且一再盘算着怎么花这笔钱。

不是咱没见过钱,克林顿时期,眼睁睁NIH的预算增加了一倍,那时候大家的腰包特别鼓,整天找地方下馆子。好景不长,布什这个战争贩子一上台,七年来NIH的预算一分没长,考虑通胀因素,等同于一共减了52亿,这对每年只有300亿的NIH不是小数目。科学家们被冷落惯了,这一次都不敢相信自己的耳朵,到处问,是真的吗,是真滴吗?然后说,嘿,这个黑人小伙子可真棒。

经济危机一开始,靠别人施舍的科研界四面受敌。制药公司自身难安,慈善家们朝不保夕,各大基金越来越难申请。每个学校的投资都在受损,哈佛大学去年半年亏掉22%,我们学校好一点,亏了16.5%,已经可喜可贺,官方说法是,在这衣不敝体的环境中临危不惧。

所以,这笔钱就像天上掉馅饼一样的撒下来。我们对着高山喊,我们有钱了,我们对着大海喊,我们有钱了。

这210亿美元,100亿分给了NIH(National Institutes of Health),30亿分给了NSF(National Science Foundation),16亿分给了DOE(Department of Energy)的科研部门。绝大部分款项必须在明年9月之前花光,所以可想而知,这两年将是大家“分田分地真忙”的两年。兄弟们,抄好了家伙,上吧!

只是有一点我始终想不明白,这么多钱是从哪儿来的呢?美国政府能拿得出来吗?

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February 17

有点小紧张

刚进实验室的时候,每天上课,实验,读文献,学习新技术、新知识,常常乱成一锅粥。那时候想,到了四五年级,不用上课了,实验做熟了,文献也读得差不多了,应该可以享受研究生生活了。转眼间就是五年级的人了,没料到还是忙着上课,做实验,读文献,一样都没有少。

上课,是去旁听生物统计,大学时候没出息,学到的全部上缴回李松岗书记了。现在科研越来越需要,不得已,重新嚼以前吃过的甘蔗,滋味还蛮浓的。

做实验更不可少,而且到了高年级,老板已经不可能耐心听你汇报失败的实验。几年前失败是成功之母,现在成功变成了失败的大爷,一个周拿不出点好看的数据,真是没脸去见老板啊。再者,自己的要求也变高了,每天瞎忙,空载回家,能郁闷一晚上。

读文献就更别提了,应了先哲的话,知道的越多,就知道的越少。以前只读和项目相关的,每个月没几篇,现在成为“饥渴慕义”的人,真是有福了。从自己的项目,到各个癌症领域,新颖的方法,药物临床测试,理论前瞻,每个周要浏览几十篇。回家和老婆一讨论,又会发现新的内容。

并且越来越意识到,这种生活,肯定还要持续很久很久。走上了科研的路,就得习惯每天学习,终生不怠。转眼间,我四年前的想法就已经过时了,大概不会有松口气的时候了。

中国人在美国发展,有着与生俱来的天然障碍,没办法克服,只有做得更优秀。看看未来,突然有点小紧张,感觉到两手空空,什么都没准备好。结局无非两种,成为“发考题”中的一员,和成为骂“发考题”中的一员。每个人都在追求成为前者,可是如果现在说,好了,你可以做“叫兽”了,好好叫吧。大概没几个人能够漂亮得叫出来。

至少,我现在肯定叫不出声。

February 07

爱我别走

周二和老板谈话,老板竟然和我提起了毕业的事,我一时间真不敢相信自己的耳朵。从一年前开始,老板就刻意回避这个话题,并坚持“瞒报”我的真实年级。譬如有人问我几年级,她会说开始在实验室的第四年,这样别人听起来会觉得我还很年幼。天可怜见,我已经是马上呆足五年的老博士生了。

老板吱唔了半天,我才听明白。其实说白了就是我这篇论文接收之后,她不好强留了,眼看着我就要一拍屁股走人了,心里真舍不得啊!于是干脆和我谈判一下,要是我自己提出来留下就好了。老板还蛮好玩的,先是捶胸顿足的叹息说我走了,我的grant就白白浪费了。接着信誓旦旦,说自己的RO1 renew没有问题的话,一定会让我作博后,加我工资,好像我别无出路了。

其实我心里真没着急。一是家在这儿,老婆在读书,我去了别的地方不方便。二是眼下经济危机,老板们个个哭穷,即使我能找到好实验室,工资肯定压得死死的,做实验也诸多限制,不像现在,我想买什么就买什么。三是我又开始了几个项目,其中一个很有趣,也有可能出大文章,再努力一年半载肯定会有成果。

但想想,觉得也有走的道理。一是显然应该毕业了,没有博士学位,总是觉得还没成熟,心理不对头。二是应该换地方学新东西,在这里折腾了四年多,营养汲取得差不多了。三是在实验室没有十分满意,实验方面老板舍得花钱,我有需要基本都会满足,可在其它方面老板实在太小气,我们都得用自己的电脑,实验室外出聚餐大家AA,组会轮流带吃的,逢年过节老板也没有任何表示,更要命的是实验条件,人家都在往新楼里搬,我们还挤在全学校最破的一座楼里,一点儿自豪感都酝酿不起来。

最后我也没有彻底决定。也许现在讨论还为时过早,毕竟论文投出后还得几个月时间,老板已经敲定,必须得等到接收之后才能毕业。在这个过程中她有大把机会可以拖着我,譬如投最好的杂志就是开始。但终究已经有了一个毕业的时间表。

要是到时老板能给我唱上一首“爱我别走”,我觉得可以考虑留下来,你们说怎么样?

January 19

第七篇

Host-deficiency in Vav 2/3 guanine nucleotide exchange factors impairs tumor growth, survival, and angiogenesis in vivo. Molecular Cancer Research.

Dana M. Brantley-Sieders, Guanglei Zhuang, David Vaught, Tanner Freeman, Yoonha Hwang, Donna Hicks, and Jin Chen

上次预告过,仍然是灌水的文章,没有值得惊喜之处。两年半前做完第一个项目时,和老板讨论下一步的工作。那时没有经验,商量出的两个项目,一个做了半年后胎死腹中,害我最后竟然要换thesis题目,惹了不少麻烦;另一个就是这篇文章,当初接手的原因是我们刚刚发表了一篇相关的论文,老板千辛万苦讨来的老鼠在那篇论文中没能好好利用,所以想用这批老鼠再做一些实验。

项目进展到一半,我实在坚持不住了,看不到任何能发好文章的前景,于时干脆搁置起来,开始做我现在的thesis项目。为此,老板对我颇为不满,并于前年底力邀实验室的名星博后来继续之前的工作。折腾了一年多,终于把水灌出来了,不用说,杂志不怎么样,影响因子4.XX

罗嗦了这么多的原因是,做研究的,尤其是老板,常常挂在嘴边的一句话:idea is cheap。意思是想法人人都有,更重要的还是做实验出来。看起来挺有道理的,可是仔细一推敲,完全靠不住。没有好的idea,第一步踏下去,就陷入万丈深渊,实验不少做,却发不了什么好paper,更重要的是,在整个项目的过程中,自己没有进步。做研究理不清大脑,手脚再利落也成不了大事,以此为戒吧。

下篇预告,自己的项目,正在做最后一个实验,争取一个月后投出。投的是Nature Medicine,我的预期是Cancer Research,又是老板逼的,别说了,眼泪花花的。

博客被封

老妈和岳母都说新博客www.tumorigenesis.com现在无法登录,怀疑受国内如火如荼的网络严打所害。正好新博客的两年空间托管合约即将满期,寻思先不续约了,把站点作了备份,下个月就会自动关闭。以后的信息会更新到这里来----没想到微软live space越做越难用了......
 
最近陆续整理几个相片册,劳烦大家把订阅地址更改成coolbeerzh.spaces.live.com,希望这个地址国内仍然可以浏览。
February 14

又搬家了哈哈

欢迎去我的新家转转:

My Life
www.tumorigenesis.com

修改和测试中,如果你遇到问题,请告诉我,如果你有需要的不能实现的功能,也请告诉我,如果你也有志自己建一个新家,我们也可以交流讨论,我可以提供免费的空间,域名自理,除非你想用www.tumorigenesis.com作为顶级域名,呵呵。

这个博客不更新了,自己搭建的博客维护起来更方便。
February 11

近况

圣诞回来后过得紧张,新旧项目没能衔接好,面临即将到来的qualify考试,数据少得有点尴尬,好在还有半年可以准备。现在的局面使人无法懈怠,自己心里面对thesis work都没有把握,如何去说服打动吹毛求疵的committee呢,遑论两年后即要以这些工作结束graduate的生活,目前心里很没有着落。

最近听了一些非常有启发的讲座,另外加上进入cancer领域以来近两年的耳濡目染,以及循序渐进的文献阅览,几天前我突发奇想,似乎时机略为成熟,可以试图申请独立域名,搭建自己的博客,内容就定位在当前的癌症研究。不光能让许多门外人和我一起了解这一肆虐了数千年、如今仍然有恃无恐的人类疾病,更能促使自己更多的学习和思考与工作息息相关的知识,再者搭建博客所利用的资源和技术也是我一直想研究的。这两天我在寻找好的web host,稍微有时间时就开始这个工作:)

没想到这么快又过年了,在国外要度过第三年春节。两年半的时间里自己还有自己所关注的许多人或事,都有了翻天覆地的变化,每念至此,都会有沉重的沧桑感压在身上,说不出的千言万语积在心头。好在时间其实是连续的,它既可以令我们都拥有历史与过去,也必能不经意间稍稍拨落时光的钟,于是旧的就走了,新的又来了,很多人都没有说什么,甚至没有感觉到。我又给家里寄了钱,以示现在自己生活独立了,这可能是出国后最大的变化了。

不知有多少人注意到慕容雪村在博客上连载新作《原谅我红尘颠倒》,他的《成都,今夜请将我遗忘》和《天堂向左,深圳向右》,都有着很深的网络印迹,也凝聚着无数的人气,之前的《伊甸樱桃》稍次,没有看完。我个人的观点,这部《红尘》如能写完,将会是一部标志‘质’的飞跃的经典之作。读了这么多小说,我发掘出三个写生活小说的天才,慕容雪村,李诗江,和老那(这个是北大校友,Oh, yeah!)。我也不知道自己的评介标准,不过大家去读读他们的作品,就知道我的意思了。希望有更多的天才被我发掘出来。

我现在有一个梦想,每天早上的时候去买bruggers的last nights bagel(主要是便宜),泡一杯浓厚的咖啡(最好是免费的),切一盘自制的卤牛肉,仰起来看一个小时的天才小说。就一个小时,要是再多,可能就没那么享受了。

January 13

超级电脑的低级人生

莫明其妙地,我竟然有电脑情结,不论么事,但凡与情结二字挂上钩的,多不是正常之事,像什么恋母情结、处女情结...(为保证本博的纯洁性恕不提供其它实例请自行举一反三)。何况Bi人一介生物狂徒,竟恋上一个死物,真是老太太靠墙喝粥看表,卑鄙无耻下流不知到了极点。

8过,躲是木有用的,我曾试图了解其它fancy新产品,诸如SLR数码相机,PDA,MP4,GPS,以喜新厌旧转而改投其它怀抱有奶便是娘的一贯作风,来抿灭自己对于电脑产品的欲火,孰知自天地以来,有些劫硬是躲不过去,这就是命,不仅电脑情结没有减退,我想买的东西的waiting list却越来越长了...去年,说话间也是前年的事了,总之有一阵子了,我在这南部一隅闲得久了,便开始手痒,赶着感恩节抢购了两块廉价硬盘的火候,盘算着组装一台超级电脑。心动莫如行动,行动也很快,在dealsea,fatwallet一干网站上搜查deal,实在不行pricegrabber也上,不管有没有打折了,连赶着忙乎了一个月,把部件整利索了,我的麻烦也开始鸟......

先是电脑插吧好了没动静,you kidding me?左看右看没少零件,换个次序再来一遍,还没反应,绝不是冷感,根本是没有任何丝毫底反应。我心想莫不是我退出电脑组装界一年半,其间潜规则已变,摸索来说明书,感觉并无猫腻,连呼见鬼。就这么着,备受期待的超级电脑躺在冰冷的地板上一个多星期,被我每天晚上蹂躏一番,不见好转,有些插头已经开始松了...我一看势头不对,立马显示出我独特的遇事不慌思维敏捷它山之石可以攻玉的优良特长,抱着我的冷感美人就去了电脑维修门市。里面的大哥看似不比我强多少,于是各种插头又被依次拨下,又依次插上,power键一按只有静电,于是大哥脑门上就开始冒汗了。我在一边也看得汗了半天,最后我说,大哥,你歇会儿,我来插一会儿吧......然后我就上了,在千万种排列组合的其中一种被我瞎猫撞到死耗子之后,奇迹出现了,电脑运作了!好大声,可是对于我来说,却是世上最最悦耳的歌声。我对大哥说,谢谢啊,缘份哪,抱着我的热火美人就回家了。

黑美人在我的卧室里闹了一年,年底,又出问题了......按power又没反应。这次我学乖了,没折腾两下,又抱到店里,换了位大哥,手艺明显上涨,配合高科技仪器,检测了几天,给我一通热线,saying,你的主板有个shortout,电源被相应的刺激了一下,stop working啦,我可以修好,给我一百五十刀。我心想,两样都买新的也不至于一百五十刀,我修电脑不行,买电脑可在行,把我当slob,小心我F你S,于是我义无反顾地抱着回家了。幸好总算知道哪些地方有问题,与厂家联络索到RMA之后,我便把主板和电源分别寄了回去。

昨天收到邮件,replacement已经UPS出来了,不日便至,我约摸着黑美人又能重返青春,回首我的超级电脑的一路人生,虽未走完,败迹已现,两个重大零件已经不是原装了...用悲惨与坎坷不平来形容实在是不为过。但还是要祝福她,在今后应该不长的日子里,挥洒过去,别出大事,发挥余热,与士民同乐,安享幸福的晚年,驱车登原欣赏美妙黄昏,誓死不作无情物,化作春泥再护人......

太惨了,我的超级电脑。

 
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